廣州艾基生物技術有限公司
Guangzhou IGE Biotechnology Co., Ltd.
廣州艾基生物技術有限公司
Guangzhou IGE Biotechnology Co., Ltd.
服務介紹 Service Introduction
近年來，病原微生物的基因組研究取得了飛速的發展。所謂基因組研究是指對微生物的全基因進行核苷酸測序，在了解全基因結構基 礎上，研究各個基因單獨或數個基因間相互作用的功能。通過基因組研究，從根本上揭示了微生物的全部基因，不僅可發現新的基因間相 互作用，新的調控因子等，這一研究將使人類從更高層次上掌握病原微生物的致病機制及其規律。從而得以發展新的診斷、預防及治療微 生物感染的制劑、疫苗及藥品。
根據研究目的不同，微生物基因組測序主要分為四種類型：微生物基因組調查、微生物基因組框架圖、精細圖和完成圖。我公司利用 illumina 平臺進行細菌基因組測序，采用短片段高覆蓋度測序，結合 illumina 末端配對測序，為不同測序研究提供個性化方案。
組裝評估標準 Assembly Evaluation Standard
服務種類 | 完成標準 |
微生物基因組調查 | 測序深度達到50X |
微生物基因組框架圖 | 基因組覆蓋度大于95%，基因區覆蓋度大于98% |
微生物基因組精細圖 | 基因組覆蓋度大于98%，基因區覆蓋度大于99% |
技術流程 Technical Procedures
生物信息學分析 Bioinformatics Analysis
生物信息學分析 | |||
基因組調查信息分析 | 基因組精細圖信息分析 | 基因組框架圖信息分析 | 基因組完成圖信息分析 |
原始數據統計 | 原始數據統計 | 原始數據統計 | 原始數據統計 |
序列的初步組裝 | 序列組裝 | 序列組裝 | 序列組裝 |
基因組大小的預測 | ORF 預測和基本功能注釋 | ORF 預測和基本功能注釋 | ORF 預測和基本功能注釋 |
GC 含量和重復序列的預測 | 完成圖繪制的建議 | 精細圖繪制的建議 | 比較基因組學和功能基因組學的分析 |
樣品要求 Sample Requirements
實驗類型 | RNA樣品總量 | 樣品濃度和純度 | 樣品保存 | 樣品選擇 |
微生物基因組denovo測序 | 小片段文庫樣品制備需要總量 3 μg 的樣品，mate-pair 文庫（2 kb、5 kb、10 kb）樣品制備需要 10-50 μg 的樣 | 樣品濃度 >100 ng/μl，OD260/280 介于 1.8-2.0 之間，無肉眼可見污染 | 請選擇干粉、酒精、TE 或超純水的保存方式之一。 | 對于細菌和真菌樣品，希望盡量來自于同一個菌株，不要有宿主 DNA 污染 |
版權所有 ? 廣州艾基生物技術有限公司
粵ICP備2021146096號
?
