轉錄組測序

服務介紹  Service Introduction

        轉錄組，廣義上指在相同環境（或生理條件）下的一個細胞、組織或生物體中出現的所有 RNA 的總和，包括信使 RNA（mRNA） 核糖體 RNA（rRNA）、轉運 RNA（tRNA）及非編碼 RNA；狹義上則指細胞所能轉錄出的所有 mRNA。轉錄組測序是研究細胞表型和 功能的一個重要手段，可以在細胞或組織水平上對整個轉錄組的時空表達進行分析。利用高通量測序技術進行轉錄組測序是一種跨界、可靠、有效的獲得轉錄組信息的手段。相對于傳統的芯片雜交平臺，轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針，即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測，提供更精確的定量信息，更高的檢測通量以及更廣泛的檢測范圍，是目前深入研究轉錄組復雜性的強大工具。通過對轉錄本表達分析可以快速發現新基因，并對 SNP 和 lnDel 變異、可變剪切、融合基因進行鑒定分析。

實驗流程  Experimental Procedures

實驗周期及測序策略

分析流程 Technical Procedures

樣品要求  Sample Requirements

結果展示 Overview of Result

        樣品PCA圖，如果兩個樣本距離越遠，則說明兩個樣本 reads 分布的差異越大。反之，則說明相應樣本 reads 整體分布模式越接近。所以，PCA 分析常用于評估樣本重復性的好壞。

        差異基因火山圖，可直觀顯示表達差異顯著性的基因/轉錄本整體分布情況，能夠得到在不同處理或不同表型的樣品之間表達顯著差異的基因/轉錄本。

        差異基因聚類熱圖，差異基因聚類分析用于判斷基因在不同實驗條件下調控模式的聚類模式。

        根據樣品基因表達譜的相近程度，將基因進行聚類分析

        直觀地展示基因在不同樣品（或是不同處理）中的表達情況，由此獲取生物學相關信息。

        差異基因KEGG 富集氣泡圖，取富集前20個KEGG繪制氣泡圖

        樣品間相關性分析是以測序獲得的所有基因或轉錄本的表達量為基礎

        分析樣品兩兩之間的表達譜是否具有相關性的手段。

        艾基生物采用 Pearson 相關系數（r）來衡量兩個變量間線性相關的關系，r 的絕對值越接近 1

        表明樣品之間表達模式的相似度越高，r 值為正值代表兩樣品的表達模式呈正相關關系，負值代表負相關關系。