微生物菌種鑒定

服務介紹  Service Introduction

          細菌的 rRNA 是細胞內含量最多的 RNA，約占 RNA 總量的 80% 以上，由高度保守區和可變區組成。

        細菌的 rRNA 包括 5S、 16S、 23S，其中 5S rRNA 信息量少，不適合分析。23S rRNA 盡管分子大，信息量多，但堿基突變速度較快，同樣不適用于細菌鑒定。16S rDNA 是編碼原核生物核糖體小亞基 16S rRNA的 DNA 序列，相比之下遺傳較為穩定，長度在 1550±200 bp 左右，信息量適中，可以用于研究系統進化。目前已經報道了 10,000 種以上的細菌 16S rDNA 序列。 16S測序是細菌菌種鑒定的金標準。 

技術流程 Technical Procedures

16s rDNA 示意圖 

樣品要求及注意事項 Sample Requirements And Notes 

•    基因組 DNA：OD 260/280 在 1.8-2.0 之間（OD260/230 最好大于 1.5），濃度 ≥ 30 ng/μl, 體積 ≥ 20 μl，且無明顯降解； 

•    建議提供培養過的菌液，體積 >2 ml，請確保提供的菌液是經過分離培養的單菌落，因樣本不純造成的測序雙峰，將全額收取實驗費用；

•    特殊樣品 , 如放線菌、厭氧菌等，請直接提供基因組 DNA，革蘭氏陽性菌，建議提供基因組 DNA；

•    不接受有致病性的樣品 , 如果菌體帶有致病性，請提供基因組 DNA，并進行加熱處理以殺死致病菌；

•    由于有些真菌形態與細菌相似，難以判斷，在無法獲得 16S rDNA 結果時，建議考慮進行真菌 ITS 區序列分析； 

•    對于測序雙峰的樣本，可以提供克隆測序的服務。

交付結果  Results Delivery

•    測序峰圖及序列文件 

•   16S rDNA 序列拼接文件 

•    序列分析比對結果 

增資服務 Additional Service

 對于測序雙峰的樣品，可提供克隆測序服務，價格：380 元 / 樣品； 包含：片段克隆，6 個陽性克隆測序，序列比對分析。

資料下載

細菌16SrDNA菌種鑒定服務委托書